Le Comité Stratégique rassemble :
- le Comité Technique,
- tous les membres signataires de la convention
- et des membres extérieurs invités tels que des représentants du GIS Sol et du RNEST, une dizaine d’experts et des partenaires intéressés par les travaux du RMT mais non signataires. Ils sont conviés pour répondre aux besoins scientifiques, techniques ou politiques ou à l’inverse pour exprimer des attentes vis-à-vis d’actions que pourrait conduire le RMT.
Le Comité Stratégique se réunit au moins 1 fois par an et examine l’avancée des travaux par rapport aux objectifs initiaux. Il peut proposer de réorienter des actions ou bien suggérer d’en initier de nouvelles. Il porte un regard sur les enjeux et les objectifs du RMT, ses réalisations, ainsi que sur les partenariats engagés ou à développer.
Un représentant de la DGER est convié, ainsi que des animateurs d'autres RMT concernés par les travaux du RMT Sols et Territoires et la chargée de mission du Bureau des sols et de l’eau du Ministère en charge de l’agriculture.

